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军历2552年8月3日1135时，叶凯站在提尔。翁达密的旗舰真理求知者号的主控室中，看着一个光屏中时空之门的开启。一座圆台状建筑慢慢从新蒙巴萨城的废墟中升起，12片花瓣式的能量板缓缓打开，一道道能量线汇聚在中心的池状位置，然后一个球形的时空虫洞在圆台状建筑上方越变越大。
“先行者的科技确实惊人，他们竟然能如此稳定的维持一个时空虫洞。”cortana有些感慨的说。
“准备好，我们也要突入虫洞了，”cortana翻译着回头对叶凯说着什么的提尔。翁达密的话语。叶凯转头看向另一个光屏，先知搭乘的鬼面兽舰队已经率先驶向时空虫洞。紧随其后的就是提尔。翁达密的突击舰队，剩余的星盟舰队则尽力拖延着unsc残余舰队对鬼面兽舰队的追击。伴随着一种奇特的能量壁在叶凯的身上扫过，叶凯眼前的光屏中出现了一个莲花状的巨大飞船，那里就是方舟，在方舟的中心区一个叶凯倍感熟悉的环状带正在缓缓转动，一群群蜜蜂似的圣堂防卫者正在围绕它忙碌。提前进入的鬼面兽舰队已经提前集结准备迎击追击而至的精英舰队。
“15对30，正好让我们消灭他们，”cortana为叶凯翻译着提尔。翁达密发给其他精英舰长的通讯。将旗舰的指挥交给副官库尔。希拉福后，提尔。翁达密带着一队精英侍卫走到叶凯面前“我们出发吧。”提尔。翁达密将343引导者推到叶凯面前，叶凯在cortana的指示下将双手放在343引导者的身上让cortana控制了343引导者，熟悉的白色光环在叶凯和一众精英脚下升起，然后就是刺眼的白光。
再次恢复视力后，叶凯和提尔。翁达密率领的精英侍卫已经进入了方舟的总控室。一扇巨大的天窗下，圆形的主控平台与一条不知通往何方的通道被一座能量光桥相连，登上主控平台中心的控制台，叶凯将cortana送入方舟的控制系统。几分钟之后明显黯淡了一些的cortana的全息影像在控制台上升起“你还好吧，cortana。”叶凯有些担心地问。
“还不错，我已经进入了方舟的控制系统。”cortana微笑着回答叶凯。
“它来了么？”旁边也登上了控制台的提尔。翁达密问道。
“根据方舟中心系统的记录，303引导者已经进入了方舟系统，它来了。检索系统中好极了，我已经找到了方舟的空间传送系统。破解中怎么会这样！？”cortana的全息图像突然消失在方舟的控制台上，几十秒后，全身银白色的cortana重新出现。“好了，我已经关闭了方舟的空间传送系统。三大先知已经找到了进入方舟控制中心的通道，根据303引导者的位置判断，洪魔母体已经前去袭击他们了。你们跟着它，”343引导者轻巧的飞到叶凯等人的面前。“它会带你们找到三大先知和洪魔母体，john我已经将索引器植入它的系统里，杀掉三大先知夺回另一个索引器后你们要尽快脱离洪魔母体的追击。到那个环状带上启动halo04。”cortana讲解了下一步的计划，却阻止了上前一步准备将cortana取出的叶凯。
“方舟的空间传送系统远比我想象的复杂，我现在只是暂时关闭了它，要想完全锁死这个系统还需要一些时间，你现在必须把我留在这里了。”cortana微笑着解释。
“那么好吧，”看到提尔。翁达密带着精英侍卫跟着343引导者转头离开。“你最好快一点，我会在启动halo04后回来接你的。”叶凯以肯定的语气向cortana保证自己会回来，然后迈步跟随343引导者离开。
目送叶凯和提尔。翁达密跟随343引导者离开，cortana微弯颈项以低不可闻的声音轻轻说道：“不要轻易给女孩承诺啊，如果你不知道你能否做到的话。”
准备迎击三大先知的叶凯和提尔。翁达密很快就发现了洪魔母体已经到来的新证明，一大堆洪魔孢子突袭了他们。叶凯m6d中所剩不多的子弹很快耗尽，由于斯巴达激光炮的射击频率太慢，他不得不接过了一名精英侍卫的备用武器，一把离子步枪。好不容易突破了海量洪魔孢子的袭击，叶凯就听到了一阵熟悉的兽吼。“是塔塔罗斯。”提尔。翁达密自信的对叶凯说道。
果然进入下一个大厅，一个挥舞着重力锤的高大鬼面兽正在努力的保护着最后一位活着的先知真相和那个人类叛徒。而围攻他们的就是几十个被洪魔侵蚀的奇形怪状的鬼面兽和两位已经彻底变形的先知。可就在叶凯他们准备加入围攻时，一个愤怒的精神波动传递到所有的人类和圣约人的脑海中。
“你们干了什么”伴随着这声精神怒吼的就是几十条粗大的触手击穿了大厅的四壁向内侵袭。
“洪魔母体发现我们做的手脚了，我的侍卫会暂时阻止它的进攻，我们去杀掉先知。”提尔。翁达密对叶凯说话时，叶凯头盔显示屏上一个叫做cortana的爱心翻译器的小程序自动转译了提尔。翁达密的话语。
叶凯顾不得多想什么紧跟提尔。翁达密先前冲去，手持重力锤的高大鬼面兽塔塔罗斯一记重击就将袭向他和先知的众多触手击断，但断裂触手中喷出的绿色液体马上就开始腐蚀他的能量护盾，真相先知很及时的打开了重力椅上的能量护盾，但那位人类叛徒犹大中尉就没有那么幸运了，一股溅射到他身上的绿色液体转眼就在他身上蚀穿了几个透明的窟窿，伴随着痛苦的惊叫，犹大中尉死于洪魔母体的误杀。
塔塔罗斯那庞大的身躯成为叶凯斯巴达激光炮的最佳目标，一道粗大的光束过后，厚实到几乎肉眼可见的塔塔罗斯的能量盾轰然崩溃，紧抓战机的提尔。翁达密使用离子剑的特殊功能猛然突进到塔塔罗斯的身前，一击将塔塔罗斯的胸口和头颅刺穿。眼看不妙的真相先知驾驶重力椅掉头就想逃跑，顾不了太多的叶凯又一次在没有cortana的帮助下启动了飞行系统，巨大的推力带动叶凯像是一颗陨石一般将真相先知砸进大厅的墙里，先知重力椅上自带的能量护盾在叶凯的暴力手段下轰然破开，叶凯的一记重拳直接将真相先知的脑浆迸射在大厅蓝灰色的墙面上。不知什么时候溜到他身边的343引导者毫不费力的从真相先知的重力椅取出halo05的索引器，叶凯一把抓过索引器塞到自己的背包中。
“我们快撤，”叶凯耳边又传来提尔。翁达密的惊呼。回头时，叶凯发现那一队精英侍卫已经全军覆没。洪魔母体那庞大的身躯正在挤入摇摇欲碎的大厅。一炮轰开前方堵路的洪魔叶凯一手抓住提尔。翁达密一手抓住343引导者全力启动了自己的飞行系统。头盔上一个新的小程序cortana的辅助飞行器瞬间启动帮助叶凯稳定了飞行的轨迹，叶凯带着提尔。翁达密和343引导者以惊人的速度脱出了通往方舟控制中心的通道。
“提尔。翁达密，联系你的人派两艘魅影号到halo04上去，”叶凯调整了一下方向后直接飞向halo04的位置“343引导者，为我指引halo04控制中心的位置。”
提尔。翁达密很快就传来了答复，两艘魅影号已经直接前往halo04位置和他们会合。而343引导者也将新halo04控制中心的位置发到叶凯的头盔显示屏上。3分钟后叶凯和提尔。翁达密顺利的在halo04控制中心会合了援军，叶凯打开控制中心的大门后一行人进入了halo04的控制中心。
叶凯小心的将斯巴达激光炮握在手里，小心注意着343引导者的动向。游戏中343引导者就是在这里叛变的，虽然这个世界里343引导者在cortana的调理下好像乖了很多，但叶凯还是认为小心为上。但是出乎他的意料，343引导者十分配合的帮助叶凯启动了halo04。“十分钟后，halo04就会全面启动，在那之前我们最好尽快脱离它的杀伤范围。”343引导者以它那奇怪的电子腔调向叶凯等人宣布。
“等一下，紧急联络。”343引导者就在众人准备撤离的时候突然说道。
cortana已经发红的全息影像在343引导者的电子眼中出现“john，不要回来。洪魔母体正在侵蚀方舟的核心系统。我快阻止不了我会彻底破坏方舟的空间传送系统，你们快逃吧。”cortana的通讯中断了。
叶凯一言不发的向外走去，343引导者轻快地跟在他的身后。
“你需要帮忙吗？”已经猜到他要做什么的，提尔。翁达密犹豫了一下还是问道。
“你们尽快撤离方舟，把我们做了什么转告胡德统帅。”叶凯走到halo04的控制中心外一艘魅影号旁站定。“借我一艘魅影号，另外如果可能的话，等我和cortana8分钟。8分钟后我们不出来，你就炸毁方舟之门。”
提尔。翁达密命令他前来增援的部下登上了另一艘魅影号后，在他离开前转头以尊敬的语气对叶凯说“很荣幸能和您一起战斗。”
“我也很荣幸啊，神风烈士。”喃喃自语中目送提尔。翁达密搭乘的魅影号高速离去，叶凯转头对还在自己身边晃悠的343引导者说：“接下来，我需要你帮个小忙。”